優勢
由于無菌冷灌裝是在常溫下灌裝，因此相對熱灌工藝來說講對PET瓶的耐熱性能要求低，因此可以使用瓶壁相對薄的PET瓶，這樣可從制瓶原料方面降低成本。在PET瓶型設計方面可以更加靈活。
以500ml裝產品為例，無菌冷灌裝PET塑瓶克重為22g，而熱灌裝則需要30g，因此，瓶胚成本可以降低近30％的瓶胚成本。
困難
無菌冷灌裝工藝在PET瓶飲料生產中實現難度很大。因為PET瓶生產是一種連續運轉作業，無菌空間大，設備速度快，各種檢測數據和控制都很復雜。這就造成了PET無菌冷灌裝機器的設計制造難度大。所以，PET瓶無菌冷灌裝生產線在當今世界飲料行業里，可以說是最先進、最復雜的生產線。
目前國內現有的PET無菌冷灌裝設備均引自國外，與之相配套的吹瓶設備等主要設備也大都由國外供應商提供。業內人士指出，造成這種現象的主要原因是國產的PET塑料瓶無菌冷灌裝設備還處于剛起步階段，普遍存在產能低、故障率高、能耗大等缺點，尤其是微生物技術是阻礙國內無菌冷灌裝設備的一大障礙。因此國內飲料企業只能依靠進口設備，而進口無菌冷灌裝設備速度很高，因此與其相配套的吹瓶等設備的速度性能也相對要求很高。而目前國產吹瓶設備不能完全與國外高速灌裝設備相配套，因此無菌冷灌裝技術還需要依靠國外供應商提供，國內供應商要想爭奪這一市場，還勢必需要繼續大力研發。
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